贵阳清真寺为贵阳市唯一的一座清真寺。据清道光《贵阳府志》记载：“清真古寺在府新城内团井巷口，雍正二年（1724年）回人所建”、道光十七年（1837年）重修。1934年由当时的乡老会捐募，并将清本巷房屋变卖筹款第二次修复、1947年由中国回教协会贵州分会再次维修并增设部分家具。新中国成立后被列为贵阳市重点文物保护单位。“文革”中遭严重破坏。宗教政策恢复后，1980年贵阳市政府拨款近20万元进行全面维修，1982年交付使用。
清真寺大门临夏状元街，坐北向南，与二门相距约30米，两道门均系牌楼式建筑。大门正中竖石碑1块，上刻“清真寺”3字，左右两侧石方柱上刻一联，曰：“清净中孚，恒系同人而集福；真诚无妄，咸歌大有以延麻”。二门左右两侧为雕花条石砌成，立中竖石碑1块，上刻阿文《古兰经》丈。上述石刻均为清代文人、教长手书遗迹。原寺建筑面积370平方米，其中大殿面积110平方米。现建筑总面积扩至63O平方米，礼拜大殿仍采用中国传统建筑形式，大木起脊歇山式，覆琉璃瓦，分卷棚、正殿、窑殿3部分，计130平方米。大殿南侧有钢混结构五层楼房1幢，建筑面积40O平方米，内设沐浴室、教长室、办公室、保管室，并附设招待所。
寺内原藏文物多毁于“文革”，其中有木刻“清真寺”长联、木刻版《古兰经》2部、手抄本《古兰经》1部，清乾隆二十四年（1759年）立“圣德源流”匾、道光三十年（1850年）立“清虚真宰”匾、咸丰元年（1851年）立“正本清源”匾等珍贵文物。
历任阿訇可知者咸丰同治年间有王朝玢，民国年间有纳举卿、杨善之、杨恒芳、马明甫、虎士祥、沙仁斋、金德宝，新中国成立后有马明甫、李被修、马仲仁、马彩庭、张廷龙。抗日战争时期，知名大阿訇马松亭避难贵阳，在寺内主持教务并讲学半年。另一著名大阿訇王静斋也避难于贵阳，住清真寺内。归真后葬于城郊老东门清真义国，后因公共建设迁至城郊周家山回民公墓。
教内现有教民1000余户，6000余人。绝大多数为回族，有少数维吾尔、东乡族，为格迪目、哲赫忍耶、伊黑瓦尼联合坊。
